在食品中，常见的酵母菌主要包括以下几种：

酿酒酵母 （Saccharomyces cerevisiae）：这是最知名和应用最广泛的酵母菌种，主要用于酿造酒精饮料如啤酒、葡萄酒，同时也用于制作面包、饼干、蛋糕等面点以及乳制品的发酵。

酒精酵母：

这种酵母主要用于生产酒精饮料，例如白酒、果酒等。

面包酵母：

用于面包制作，帮助面团发酵，产生二氧化碳气体，使面包膨胀。

果酒酵母：

专门用于发酵果酒，如葡萄酒、苹果酒等。

酱油酵母：

用于酱油的发酵过程。

毕赤酵母（Pichia pastoris）：这是一种兼性厌氧的酵母菌，能在无氧和有氧条件下生长繁殖，广泛应用于蛋白质表达、药物筛选、生物传感器等方面。

念珠菌（Candida）：虽然通常被认为是致病菌，但在某些情况下，如制作面包和发酵乳制品中，念珠菌可以改善产品的口感和质量。

乳酸菌（Lactobacillus）：这类细菌能够产生乳酸，广泛应用于乳制品、饮料、酱菜等食品中，具有调节肠道菌群、增强免疫力、抑制病原菌等益生作用。

醋酸菌（Acetobacter）：用于将酒精氧化成醋酸，广泛应用于醋的发酵过程。

发酵曲霉和 红曲霉：

常用于食品和饮料的发酵过程中，例如生产柠檬酸和纤维素酶，以及发酵红曲米制作红曲米酒和红曲素。

这些酵母菌和微生物在食品工业中扮演着重要角色，不仅提高了食品的口感和营养价值，还有助于食品保存和延长保质期。建议在实际应用中根据具体需求选择合适的酵母菌种。