深圳办理食品经营许可证的流程如下：
网上申请
申请人首先需要登录广东政务服务网，找到并选择“食品经营许可证核发”事项，然后进行在线办理。
在网上申请过程中，申请人需要填写电子申请表单，上传所需的申请材料，并确保所有信息和资料的真实性和完整性。
提交材料
申请人需要准备并提交以下材料：
营业执照副本和复印件。
食品经营许可申请书。
法人的身份证信息以及联系方式。
食品安全管理员的身份证复印件。
食品安全管理制度。
与挂钩生产单位的合作协议（如适用）。
经办人身份证明和委托书（如非法定代表人申请）。
现场核查
工商部门会对申请人提交的材料进行现场核查，以确保申请人的生产经营场所符合相关食品安全要求。
对于仅销售预包装食品的申请，可能不需要现场核查，流程会相对简单。
审批与领证
审批通过后，申请人会收到《食品经营许可证》。
审批不通过的情况下，申请人会收到《不予许可决定书》，并需要按照要求整改后重新申请。
办理时限
办理食品经营许可证的时限通常为20个工作日。
办理费用
办理食品经营许可证是免费的。
建议：
申请人应提前准备好所有必要的材料，并确保材料的真实性和完整性，以加快审批流程。
选择网上办理方式可以节省时间，并且可以随时随地进行申请。
如果现场核查遇到问题，应及时与工商部门沟通，并按照要求整改。
