食品被海关扣了后，可以按照以下步骤办理：

及时联系报关行

货物被扣后，海关通常会发通知。要仔细看清通知的内容，注意问题出在哪里，然后及时通知报关行。

准确回复海关并提供充足证据

海关在下达通知后会给一定时间来准备要提供的文件材料等。这些都要看清楚，要在通知规定的时间内回复。如果想要回复信件给海关也可以，那就要在报关行的配合下，把这些资料通过报关行发给海关。

补交关税

如果是因为申报货值太低被扣的，则需要补交关税。海关查验一般是三个工作日就会放行。

提供相关证明材料

海关可能会要求提供一些证明材料，如物品的购买发票、税单、物品的使用说明等，以证明货物的合法性。

提交书面申请

当物品被海关扣留后，需首先向相关海关部门提交书面申请。申请中应详细描述物品信息、入境日期、原因等。

缴纳相关费用

如存在税款未缴清的情况，需按照海关要求缴纳相关税款和罚款。

货物查验

海关会对扣留的货物进行查验，以确保货物的品名、数量、价值等信息与申报信息相符。

放行或进一步处理

查验无误后，海关会放行货物。如存在问题，海关会进一步处理，如要求退运、销毁或进行其他调查。

申请货物退运

如果货物无法通过海关查验，或者因为某些原因无法清关，可以向海关申请货物退运，按国际惯例，清关不了的货物可以申请退运回发货地或是第三方贸易港口。

寻找专业代理

如果手续不全或需要相关认证手续，可以寻找有进口权的公司代理清关，或者找专业的进出口代理公司协助处理。

以上步骤仅供参考，具体操作时可能因地区和具体情况有所不同。建议及时与海关和报关行沟通，了解详细要求和流程，以便顺利完成清关手续。