特殊养殖需要办理的证件主要包括以下几种：
野生动物驯养繁殖许可证：
用于驯养繁殖野生动物，如梅花鹿、孔雀、野猪等，需要向林业行政主管部门提出申请，并经过批准。
野生动物经营许可证：
涉及野生动物及其产品的经营和利用，需要办理此证件。
动物防疫合格证：
根据《动物防疫法》规定，从事养殖业必须办理此证件，以证明养殖场所符合动物防疫条件。
排污许可证：
在依法实施污染物排放总量控制的区域内，畜禽养殖场必须取得《排污许可证》，并按照其规定排放污染物。
养殖证：
对于海域水产养殖和内陆水域养殖户，需要依法取得《养殖证》。
土地手续：
包括生产设施用地的备案手续和签订用地协议，养殖场的选址还需通过规划局的审批。
环境影响评价（环评手续）：
从选址到最终养殖场生产运行整个流程都需要通过环评进行认定和分析预测，需要配套建设污染防治设施。
特种养殖证：
例如养黑天鹅等，需要向当地林业局提交书面申请报告，并经过市林业局的审查批准。
可行性研究报告或总体规划：
申请驯养繁殖野生动物项目时需要提交。
种源来源证明材料：
申请驯养繁殖的野生动物种源来源证明材料。
技术人员资格证书：
包括畜牧师、兽师等技术人员的技术资格证书。
资金保障证明：
证明有足够的资金进行养殖活动。
建议您在办理特殊养殖证件时，详细咨询当地林业部门或相关机构，以确保材料齐全、流程合规。
