甲鱼违法养殖的处罚主要依据《中华人民共和国渔业法》和《中华人民共和国农产品质量安全法》等相关法律法规。具体处罚如下：

非法占用农用地养殖甲鱼

例如，刘某在未经主管部门批准、未办理用地审批手续的情况下，将高标准农田改造为鱼塘用于养殖甲鱼，被以非法占用农用地罪判处有期徒刑一年九个月，缓刑三年，并处罚金三万元。

未办理环保手续养殖甲鱼

海南光信科技有限公司在未办理任何环保手续的情况下，在文昌湖山水库二级保护区内养殖甲鱼，影响当地饮用水安全，被罚款3万元，并责令停止生产。

未依法取得养殖证养殖甲鱼

根据《中华人民共和国渔业法》第四十条，未依法取得养殖证擅自在全民所有的水域从事养殖生产的，责令改正，补办养殖证或者限期拆除养殖设施，可以并处一万元以下的罚款。

使用禁用方法或工具捕捞甲鱼

使用炸鱼、毒鱼、电鱼等破坏渔业资源方法进行捕捞的，违反关于禁渔区、禁渔期的规定进行捕捞的，或者使用禁用的渔具、捕捞方法和小于最小网目尺寸的网具进行捕捞或者渔获物中幼鱼超过规定比例的，没收渔获物和违法所得，处五万元以下的罚款；情节严重的，没收渔具，吊销捕捞许可证；情节特别严重的，可以没收渔船；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

建议

合法合规养殖：养殖甲鱼应首先取得合法的养殖证，并严格遵守相关法律法规，确保养殖活动不会对环境和公共利益造成损害。

环保手续：在养殖过程中，应办理相应的环保手续，确保养殖活动符合环境保护要求。

社会监督：公众和相关部门应加强对养殖活动的监督，及时发现和制止违法行为，保护自然资源和生态环境。

通过以上处罚措施和法律依据，可以看出国家对非法养殖甲鱼的打击力度较大，违法者将面临严重的法律后果。因此，建议相关养殖企业和个人严格遵守法律法规，合法合规开展养殖活动。