养殖公司的税务处理如下：

增值税

养殖公司在购买和销售牲口时需要缴纳增值税。

需要将应纳增值税和销项税额分别列入会计科目，并在按月或按季度进行的增值税申报时缴纳。

如果销售额中包含个人的代售款项，代售所得还需交纳个人所得税。

企业所得税

养殖场需要缴纳企业所得税，根据《中华人民共和国企业所得税法实施条例》，企业所得税是减半征收的。

农业公司一般要交企业所得税，具体税率和缴税周期需根据当地税务部门的要求。

个人所得税

如果养殖公司中有个人代售款项，代售所得需要交纳个人所得税。

其他税种

养殖场还需要交环保税。

如果有进出口货物，也需要交关税。

如果养殖场占用耕地，需要交耕地占用税，一次性缴纳。

印花税方面，主要是实收资本需要缴纳，以及公司与公司之间的买卖合同需要缴纳。

房产税和土地使用税一般按季度申报。

免税政策

种植业和养殖业不需要缴纳流转税（如增值税、营业税、消费税等）。

农业生产者销售的自产农产品免征增值税。

报税和缴税

农业公司应当在工商行政管理部门进行登记，并向当地税务部门申请纳税人登记。

农业公司需要了解自己应当缴纳的税种、税率和缴税周期等相关信息。

根据当地税务部门要求，农业公司需按照规定时间和方式缴纳税款，可以通过线上或线下方式缴纳税款。

农业公司应当按照规定时间向当地税务部门进行报税申报，报税申报内容包括纳税人的纳税情况、税种、税率、缴纳金额等相关信息。

建议养殖公司详细咨询当地税务部门，了解具体的税种、税率和缴税流程，以确保合法合规经营并按时完成各项税务申报和缴纳工作。