在水产养殖中，常用的菌种包括以下几种：

光合菌：

光合菌能够进行水体脱硫，产生抗病毒物质，提高水产养殖动物的抗病毒能力，分解水体中小分子有机杂质，提高水体的透明度，起到间接增氧的作用。光合菌在雨前使用效果更好。

乳酸菌：

乳酸菌可以内服和外泼。内服可以修复肠道菌群屏障，调节肠道菌群平衡，分泌乳酸和消化酶，增强营养代谢和免疫力；外泼可以分解剩料、粪便等有机质，降解氨氮等有害物质，降低水体pH，改善水体环境。

芽孢杆菌：

芽孢杆菌能够分解水体大分子有机质，降解氨氮、亚硝酸盐等有害物质，提高水体的活力和自净能力，形成优势有益微生物菌群，抑制病原菌和有害藻类，改善养殖生态环境，刺激动物免疫器官生长发育，补充消化酶不足，促进消化吸收。

EM菌：

EM菌（有效微生物群）是由多种有益菌种混合培养而成，能够抑制病原微生物和有害物质，促进养殖生态系中的正常菌群和有益藻类活化生长，保持养殖水体的生态平衡。EM菌的使用可以增强鱼类的吸收功能和防病抗逆能力，促进健康生长。

酵母菌：

酵母菌能够黏附在肠道中，刺激鱼虾体内淀粉酶和刷状缘膜酶的分泌，提高动物对食物的利用率。酵母菌在消化道内大量繁殖，成为优势种群，抑制有害菌的生长。

硝化细菌 和 蛭弧菌：

硝化细菌负责将氨氮转化为亚硝酸盐，而蛭弧菌可以捕食有害菌，有助于维持水体中的微生物平衡。

β-葡聚糖：

β-葡聚糖是一种免疫增强剂，能够增强鱼虾的抵抗力，对抗致病菌群引起的疾病，甚至阻断白斑病毒（WSSV）对虾的影响。β-葡聚糖通常用于拌料喂虾。

建议

根据不同的养殖需求和水体环境，可以选择适合的菌种进行拌料。例如，在高温季节，可以适当增加乳酸菌和EM菌的使用量，以抑制有害菌和有害藻的生长，改善水体环境。同时，建议定期更换菌种，以保证微生物菌群的多样性和活性。