环保公司进行会计处理时，需要遵循以下步骤和注意事项：

财务会计方面

履行普通企业的会计核算和报告职责，包括日常记账、编制会计凭证、核算各项业务收入、费用、成本和费用等。

关注固定资产和无形资产的折旧、摊销核算，正确反映企业资产价值、负债水平和盈利能力。

遵守税务法规，按时申报各项税金，并进行预提税费等处理。

管理会计方面

通过管理会计方法对企业的经济业务进行预测、规划和控制，包括制定预算计划（如投资预算、费用预算和收入预算）。

建立成本会计体系，实施相关的成本核算、成本控制和成本分析工作，确保企业经营成本的透明度和合理性。

特殊账务处理

涉及碳排放权交易的企业，需要建立相应的碳排放权管理与会计处理机制。

涉及环境污染治理和修复的企业，需要核算相关的环境成本和环境资产，并进行适当的折旧和摊销。

财务软件与内部控制

利用专门的财务软件进行账务处理，提升账务处理的效率和准确性。

建立健全的内部控制制度，确保账务处理过程的规范性和合规性。

环保项目资金流管理

设置环保项目专项账户，分类记录环保投入与收益。

根据环保项目合同及发票，准确录入账务系统，确保收支明细清晰。

定期审核环保设备采购、维护费用，确保成本合理分摊。

政府补贴与税收优惠

处理政府补贴、税收优惠等环保相关政策账务，确保合规性。

编制环保项目财务报告，分析环保投资效益，为管理层提供决策依据。

环保设备投资与折旧

对环保设备投资进行长期规划与折旧，确保数据准确。

财务报表编制与分析

编制会计报表及各种明细表，进行财务报告分析，并将相关报表上报给公司财务经理及总经理。

税务筹划与合规

根据税收政策，合理规划税负，利用环保项目税收优惠政策。

保持与税务机关的良好沟通，确保税务合规。

通过以上步骤和注意事项，环保公司可以确保其会计处理的准确性和合规性，同时为管理层提供有价值的财务信息以支持决策。