环保补助资金的使用应当遵循以下步骤和原则：

确定资金来源

通过多渠道筹集资金，包括政府补助、社会捐赠、企业赞助等，确保资金来源的多样性与稳定性。

建立资金来源登记表，详细记录每项资金的来源、金额及用途，确保信息透明。

制定资金分配方案

根据各环保项目的优先级与实际需求，制定资金分配方案。

使用优先级评分法对项目进行评估，确保资金优先用于环境影响较大、急需改善的项目。

资金分配方案应包括项目名称、预算金额、资金用途、预期效果。

建立资金使用审批流程

设立专门的资金使用审批小组，负责对各项资金使用申请进行审核。

审批流程包括资金使用申请提交、资金使用审核、资金使用批准、资金拨付，每一步骤应有明确的责任人，确保审批过程的高效性与透明度。

资金使用监督机制

建立资金使用监督机制，确保每项资金使用都有详细的记录，并定期进行审计。

监督机制应包括定期检查资金使用情况、资金使用结果的评估、反馈与改进机制，实施定期报告制度，各项目负责人需定期提交资金使用情况报告，并说明项目实施进展与资金使用效果。

项目实施效果评估

在项目实施结束后，需对项目的实施效果进行全面评估。

评估结果应作为今后资金分配和项目选择的依据，以确保资金的有效利用和项目的持续改进。

明确投入主体责任

坚定落实好生态环境领域财政事权和支出责任划分改革方案，落实好各级政府的投入责任，发挥好中央财政资金的引导作用，调动各级地方政府加大投入。

坚持“谁污染，谁治理”的原则，在投入方式上，宜减少事前补助，增加事后激励比重，通过竞争性评审推进的山水林田湖草沙一体化保护和修复工程、农村黑臭水体治理试点工程等方式，提高资金的使用绩效。

创新环保专项资金使用监管问责制度

建立对环保专项资金使用不规范或不到位地区的停止或限止拔付或补助环保专项资金制度，以震慑地方政府和企业，规范使用环保专项资金行为。

严格对各种环保专项资金使用监管问责制度加以执行落实，包括环保项目申报预审制度、竣工验收制度和跟踪监测其使用绩效情况制度，发现问题，及时问责。

以奖代补

环保专项资金的支持方式应当逐步过渡到以“以奖代补”为主，体现地方政府和企业治污的主体责任，断绝等、靠、要的思想，提升治污积极性。

选择具有良好示范作用的对象进行精准支持，着重支持重点污染源防治、区域性污染防治、污染防治新技术及新工艺的开发、示范和应用。

通过以上步骤和原则，可以确保环保补助资金的有效使用，促进环境保护事业的发展。