针对农机环保不达标的问题，可以采取以下处理措施：

责令改正与处罚

对于生产或销售达不到国四排放标准（560kw及以下）的农业机械，市生态环境保护局将依法责令改正，并处以货值金额一倍以上三倍以下的罚款。若拒不改正，将责令停产整治。

销售不符合排放标准的农机，县级人民政府市场监督管理部门将没收违法所得，并处以货值金额一倍以上三倍以下的罚款，同时责成销售者负责修理、更换、退货；若给购买者造成损失，销售者应当赔偿损失。

禁止使用与维修

禁止使用冒黑烟、高排量的农业机械，一旦发现应责令停用并进行维修。若经维修仍不达标，则不允许作业使用。

报废与淘汰

对不符合国家第三阶段污染物排放标准的拖拉机和联合收割机，严禁办理注册登记或变更转移登记手续。达到报废标准或超过报废年限的，要依照规定做好注销和淘汰工作。

监管与评估

通过强化农机作业的监管和评估，加强对农机设备的环保性能要求，鼓励研发制造更加环保的农业机械，减少尾气排放和噪音污染。

培训与教育

加强农机作业过程的环境保护培训，提高农民的环境保护意识和技能，教授正确使用农业机械的方法，注意机械的维护保养，减少对环境的损害。

政策制定与完善

鼓励农业机械政策的制定和完善，以保护环境。

废弃物处理

农机修理过程中产生的废弃物，如废油、废水、废旧零件等，应进行分类处理。废油可以通过油水分离设备进行分离后再次利用，废水需经过处理后排放，废旧零件可以回收再利用或进行安全处理。

法律途径

环保不达标的企业可以依法处置，企业应积极学习和了解国家相关环保政策，避免因信息落后造成麻烦。

综上所述，处理农机环保不达标的问题需要从多个角度出发，包括行政监管、法律处罚、技术创新、教育培训以及废弃物处理等多方面措施，以确保农业机械符合环保标准，减少对环境的影响。