工程施工辅助费包括以下几项内容：

生产工具用具使用费：

指施工生产所需不属于固定资产的生产用具及检验、试验用具等的购置、摊销和维修费，以及支付给工人自备工具的补贴费。

检验试验费：

指对建筑材料、构件和建筑安装物进行一般鉴定、检验所发生的费用（包括自设实验室进行试验所耗用的材料和化学药品费用等），以及技术革新和研究试验费。不包括新构件、新材料的试验费和建设单位要求对具有出厂合格证明的材料进行检验，对构件破坏性试验及其他特殊要求检验试验的费用。

工程定位复测、工程点交、场地清理费：

这些费用涉及工程定位的重新测量、工程交底以及施工现场的清理工作。

施工队伍进退场费：

指施工队伍承担工程施工时所使用的船舶及施工机械进入和退出施工现场的费用及派出部分施工力量所发生的往返调遣费用。内容包括：调遣期间职工工资、差旅交通费、施工船舶、机械、工具、器具、周转材料和生产及管理用具的调遣和运杂费，以及船舶、机械在调遣时需要开舱、封舱、改装、复原、拆卸、安装的费用。

临时设施摊销费：

指为完成施工任务而在施工现场搭建的临时设施所发生的费用在施工期内进行摊销而进入成本的费用。

外海工程拖船费：

指大型工程船舶在外海施工时，由于风浪水流等原因不能连续驻船作业，必须拖回临时停泊地而发生的船舶拖运费。航务工程的外海工程拖船费并入船机使用费核算。

高原地区增加费：

指在海拔高度在200米以上地区施工，由于受气象、气压影响，致使人工、机械效率降低所增加的费用。

行车干扰工程增加费：

指由于边施工边维持通车，受行车干扰的影响，致使人工、机械效率降低而增加的费用。

这些费用都是为了保障工程施工的顺利进行而发生的，涵盖了从工具用具的使用到工程完工后的清理等各个阶段。