发酵工程师在转行时，有多种选择可以考虑。以下是一些可能的转行方向：

食品行业

发酵工程师可以在食品企业从事食品加工、食品研发和食品质量控制等工作。随着人们对健康食品和功能性食品需求的增加，这一领域的就业机会也在增加。

生物制药行业

在生物制药企业，发酵工程师可以从事生物药物的研发、生产和质量控制等工作。随着生物技术的不断发展和生物药物市场的扩大，这一领域的需求也在增加。

环境保护行业

发酵工程师可以在环保企业从事废水处理、废气处理等环境工程方面的工作。随着环境污染问题的日益严重，对环境保护技术和人才的需求也在增加。

科研院所和高校

发酵工程专业毕业生可以选择从事科研工作或在高校从事教学和科研工作。在科研院所和高校中，发酵工程专业人才的需求较大。

其他行业

除了上述行业，发酵工程师还可以选择进入新能源、快速消费品、化工、环保、生物信息学等领域从事相关研发或生产工作。

跨专业发展

有些发酵工程师可能会选择跨专业发展，例如进入计算机科学、数据分析、市场营销等领域，这些领域对具有跨学科背景的人才需求也在增加。

建议

了解自身兴趣和长期职业规划：在选择转行的方向时，建议结合自身的兴趣和长期职业规划，选择最适合自己的领域。

提升技能：无论选择哪个方向，都需要不断提升自己的技能，以适应新领域的需求。

关注行业动态：发酵工程和相关行业的发展趋势和市场需求不断变化，建议定期关注行业动态，以便及时调整自己的职业规划。

通过以上分析，可以看出发酵工程师在转行时有多种选择，可以根据自身情况和兴趣选择合适的方向。