在工程项目中，不同的管理部门对项目的影响和重要性各不相同。以下是一些工程部门可能最怕的管理问题：

施工队管理问题

缺乏有效的沟通与协调：施工队与项目部之间沟通协调不畅，可能导致项目进度无法及时得到控制和调整，出现误解和冲突。

资源管理不善：施工队对项目所需资源的管理不当，如材料采购不及时、施工设备维护不到位，会导致资源浪费和成本增加。

岗位责任不明确：施工队内部岗位职责没有明确的划分，造成工作流程不畅，责任推诿和错位的现象较多。

资质管理问题：施工队伍的资质不合格或存在问题，可能导致项目出现质量问题、工期延误或安全隐患，给项目部带来严重的经济和声誉损失。

人员管理问题：施工队伍的人员素质和综合能力不足，如缺乏技术经验、团队合作能力差、执行能力不足，可能导致项目无法顺利进行，出现质量问题和交付延误。

安全管理问题：施工工地的安全管理不到位，可能导致工人安全事故的发生，给项目部及相关方带来法律和经济风险。

国家建筑工程质量监督检验中心

该部门负责建设工程质量和工程检测的监督管理工作，对项目质量有严格的监督检查职责，如发现不规范或质量问题，可能导致项目停工整改，给工地带来巨大损失。

住建局

住建局负责工程项目的质量管理和安全监督，如发现不规范或质量问题，可导致项目停工整改，对工地造成重大损失。

财务部门

财务部门管理涉及项目资金的支出和收入，是项目运作的关键环节。如果管理不善，可能导致项目资金不到位、预算超支、成本控制不力等问题，影响项目的正常运行和项目效益。

财务部门还需负责项目报账、审批、结算等工作，管理不严格可能导致项目报账出现错误或违规情况，影响项目的合法合规性，甚至引发财务风险。

行政管理部门

行政管理部门负责项目的人力资源管理、财务管理、采购管理、办公设备管理等方面的工作。由于对项目的特殊性和需求了解不足，常常无法提供及时有效的支持，导致项目运作不畅。

行政部门的管理层次繁多、决策程序繁琐，导致项目决策慢、效率低下，影响项目的顺利进行。

安监局和质监局

这些部门负责施工现场的安全和质量问题，有权对施工方进行考核罚款，甚至取消其施工资格，对施工单位有较大压力。

社会保险行政部门

负责认定工伤和赔付费用，建筑商需在规定时间内提出工伤认定申请，否则需承担相应费用，是建筑商较为担心的部门。

综上所述，工程项目中最怕的管理部门包括施工队自身的管理问题、国家建筑工程质量监督检验中心、住建局、财务部门、行政管理部门、安监局、质监局和社会保险行政部门。每个部门都有其独特的监管职责，对项目的影响也各不相同。因此，项目部需要与这些部门保持良好的沟通和协调，确保项目的顺利进行和成功完成。