制作工程专业主要学习的科目包括以下几个方面：

有机化学：

学习有机化学的基本知识和理论，掌握有机合成的基本技能。

物理化学：

研究物质在物理状态下的性质和变化规律，包括热力学、动力学、量子化学等。

化工原理：

学习化工过程的基本原理和操作方法，包括流体力学、传热、传质等。

药物合成化学：

研究药物合成的基本原理和方法，包括药物设计、合成路线选择等。

制药工艺学：

学习药物生产过程中的工艺技术和设备操作，包括制剂制备、质量控制等。

药物化学：

研究药物的结构、性质、合成和应用，包括天然药物化学、药物分析等。

药理学：

研究药物的作用机制、药效学和药代动力学，为药物研究和开发提供理论基础。

药剂学：

学习药物制剂的基本原理和制备方法，包括片剂、胶囊、注射剂等。

生物化学：

研究生物体内化学过程和物质，包括蛋白质、核酸、酶等。

工程实践：

通过实验和工程实践，培养实际操作能力和工程思维。

计算机应用：

学习计算机在工程领域的应用，包括编程、数据分析、仿真等。

科学研究与工程设计方法：

掌握科学研究和工程设计的基本方法，培养科研和工程能力。

此外，根据不同的专业方向，还可能包括以下课程：

气工程与智能制造专业：电路原理、电机原理与基础、数字电子技术、自动控制原理、电力电子技术、电力系统基础等。

智能制造工程专业：人工智能技术、物理电子、光电子、微电子学、电子线路、计算机语言、微型计算机原理、电动力学、工业机器人技术、数据库技术、信号与系统、电磁场与电磁波等。

微电子制造工程专业：半导体物理及实验、半导体器件物理、集成电路设计原理、集成电路工艺原理、集成电路CAD、微电子学专业实验和集成电路工艺实习等。

能制造工程专业：机械工程基础、控制工程基础、电工与电子技术、计算机网络与工业物联网、RFID技术与应用、人工智能技术及应用、计算机智能控制系统、嵌入式系统与应用、工业机器人技术与应用、数控机床与编程、电气控制与PLC应用、传感器与检测技术、智能装备故障诊断与维修、智能仪器技术、数字化制造技术、智能生产计划管理（MES/ERP）、智能工厂集成技术、智能生产系统与CPS建模等。

这些课程共同构成了制作工程专业的知识体系，旨在培养学生具备从事医药产品、智能制造和微电子制造等相关领域开发与生产的基本能力。建议学生在学习过程中注重理论与实践相结合，通过实验、实习和项目实践来提升自己的实际操作能力。