在工程审计过程中，审计人员应该注意以下几个关键方面：

项目前期阶段风险

立项合规性风险：审查项目立项是否符合相关政策、规划要求，有无经过正规审批流程。若立项手续不完善，可能导致项目后续推进存在合法性问题，甚至面临被叫停的风险。

可行性研究风险：对项目可行性研究报告的真实性、科学性需重点关注。部分项目可行性研究可能存在数据不准确、分析不到位的情况，使得项目实际建设中成本超支、效益未达预期等，影响审计对项目整体评估的准确性。

招投标环节风险

招标程序风险：查看招标公告发布是否合规、广泛，投标单位资质审核是否严格。若招标程序存在漏洞，比如未按规定时间发布公告，或者让不符合资质的单位参与投标，容易滋生围标、串标等不正当行为，破坏公平竞争环境，也影响工程最终质量与造价。

招标文件风险：审核招标文件条款是否清晰、合理，特别是对工程造价、结算方式、质量要求等关键内容的规定。模糊不清的条款往往会在后续施工和结算阶段引发诸多争议，增加审计工作的复杂性与难度。

合同签订与管理风险

合同条款风险：合同中关于工程价款调整、变更签证、违约责任等条款如果约定不明，双方容易在履行过程中产生分歧。例如，对于材料价格波动情况下如何调整价款没有明确约定，在材料大幅涨价时就易引发施工方与建设方的矛盾，也给审计认定带来阻碍。

项目预算与结算风险

预算超标风险：检查项目结算总额是否超过预算总额，预算变更和调整是否得到领导批准；单项工程预算编制是否真实准确，包括工程量计算是否符合规定的计算规则，是否准确；分项工程预算定额的选择是否合规、恰当。

签证手续风险：检查签证表是否由业主现场代表、承包商和监理工程师签字盖章。签证在签字过程中模仿手写、变相复印、他人代笔等行为都应该被严格禁止。

工程量一致风险：审核工程量时，应特别注意工程量签证。审核时必须到现场逐项测算，逐一核实。特别是对装饰工程和附属工程的隐蔽部分应作为审核的重点，因为这两部分往往没有图纸或者图纸不很规范，而现场勘察又比较困难。

设备价格与质量风险

设备价格风险：在审核设备或材料时，应注意合同价格的合理性，材料和质量是否与合同约定一致，并结合合同设备清单和财务结算发票的审核。

合规性与风险管理

合规性风险：审查项目的合规性，包括法律法规和政策规定等，以确保项目的合规性和合法性。

风险评估：审计人员需要对项目的风险进行评估，包括技术风险、财务风险和环境风险等，以确保项目的风险可控和投资回报。

审计方法与准备工作

审计方法：采用看图法、全面审核法和重点审核法等审计方法，确保审计的科学性和规范性。

审计准备工作：审计人员需要准备审计工作要求、审计流程和审计方法等，确保审计工作的顺利进行。

文件归档与记录

文件归档：审计人员需要对审计过程中的文件和资料进行归档管理，确保审计结果的可追溯性和可验证性。

通过以上这些方面的细致审查和风险评估，可以有效降低工程审计中的风险，确保工程项目的合规性、质量和效益。