国企工程审计的主要内容包括以下几个方面：

审查决算资料的完整性：

确保所有必要的决算资料都已齐全，无遗漏。

竣工财务决算报表和说明书完整性、真实性审计：

核实报表和说明书的真实性，确保数据准确无误。

各项建设投资支出的真实性、合规性审计：

检查投资支出是否真实发生，是否符合相关法律法规。

建设工程竣工结算的真实性、合规性审计：

审计竣工结算是否真实、合规，符合合同约定和法律法规。

概算执行情况审计：

检查实际支出是否在批准的概算范围内。

交付使用资产真实性、完整性审计：

核实交付使用的资产是否真实存在，是否完整。

结余资金及基建收入审计：

审计结余资金和基建收入的处理是否合规。

尾工工程审计：

对未完成的工程部分进行审计，确保按计划完成。

中标通知书和招标文件的审计：

审查中标通知书和招标文件的内容，确保其真实性和合规性。

图纸会审记录和监理工程师通知或业主施工指令的审计：

核实相关记录和指令的真实性和合规性。

施工合同的审计：

审查合同内容，确保双方权利和义务符合法律法规。

设计变更和工程结算的审计：

审计设计变更的合理性和工程结算的准确性。

企业损益方面的审计：

审核企业损益计算的真实性、正确性和合法性。

建设项目开工前和施工阶段的审计：

包括项目审批文件、施工准备阶段的质量控制、监理工作、施工单位选择等。

资金来源和使用情况的审计：

审计建设项目的资金来源是否合法、合规，是否专户存储，以及资金是否满足项目建设需要。

各种规费和税费的审计：

检查是否按规定及时缴纳各种规费和税费。

征地或拆迁补偿费的审计：

核实征地或拆迁补偿费是否符合相关规定，评估和计价是否合规、合理。

通过这些审计内容，可以全面评估国企工程项目的合规性、真实性和效益，确保项目按计划、按预算完成，并符合相关法律法规要求。