工程竣工审计的内容主要包括以下几个方面：

竣工决算报告的编制情况

审查决算编制的责任单位、编制依据、资料齐全性、手续完备性以及项目遗留问题的处理合规性。

关注实际投资会计的真实性和准确性，特别是建安工程投资、设备投资、待摊投资等费用的核算和分摊是否合理合规。

项目建设和概算实施情况

取得项目竣工决算表，整理总结概算与实际投资的比较明细表，重点关注是否存在超概算或节约的情况，并分析具体原因。

审查项目建设是否按照批准的初步设计概算进行，是否存在概算外项目或扩大工程规模等问题。

建设项目资金来源

审核建设资金来源是否与设计概算内容一致，并关注建设资金到位情况，确保项目资金的合法合规使用。

交付使用财产和在建工程造价的真实性

关注交付使用财产是否真实、完整，移交程序是否合规，同时审查在建工程造价的真实性，确保各项费用支出合理合规。

工程造价的真实性和合规性

重点审查成本核算的完整性，关注是否存在占用工程成本、提高工程造价或转移建设投资等问题。

审查工程量的准确性、材料用量和价差的合理性以及工程定额的应用情况。

尾工程及预留款项

对尾工及预留款项进行审查，确保尾工工程未完部分预提费用的合理性以及双方经济往来是否清楚。

项目合同管理与结算审核

审查工程合同是否已按约定履行完毕，包括工程范围、质量、工期、价款等关键条款的执行情况。

确保所有结算资料齐全、准确，包括工程量结算清单、变更签证、验收报告等，以支持结算金额的合理性。

项目建设及概算执行情况

审查项目建设是否按批准的初步设计进行，各单位工程建设是否严格按批准的概算内容执行，有无概算外项目和提高建设标准、扩大建设规模的问题。

对比实际完成的工作量与预算工作量，分析是否存在概算变更，对超支和节余项目，应分析其原因是否合理。

项目招标、采购和发包情况

审核项目发包过程是否遵循相关法律法规和规章制度，采取合法合规的发包方式。

检查招投标过程是否严格遵循了国家及地方关于招投标的法律法规，确保程序的合法性和规范性。

审查招投标过程中产生的各项费用是否合规、合理，支付凭证是否齐全、真实。

项目资金来源与使用情况

确认资金来源的渠道是否符合国家有关规定，对于非经营性项目，需审核资金是否按批复要求拨付。

审查各种资金渠道投入的实际金额、实际完成投资额及资金到位情况，并关注是否存在转移、挪用建设资金等问题。

建设成本节约和超支的原因

根据设计概算或基本建设投资包干指标，审查竣工项目的建设成本节约或超支的具体原因。

转出投资、应核销投资和应核销支出的列支依据

审查转出投资、应核销投资和应核销支出的列支依据是否充分，手续是否完备，内容是否真实，核销是否合规，有无虚列投资的问题。

建设工期

审查是否按计划开工和竣工，查明建设速度加快或延缓的原因，明确责任。

工程质量

审核是否符合工程质量检验评定标准和验收规范，有无不符合质量要求的工程，有无报废工程。

投资效益

从物资使用、新增生产能力、预测投资回收期等方面评价投资效益。

尾工工程的未完工程量

审查、核实尾工工程的未完工程量，防止将新增项目列为尾工项目和增加新的工程内容。

通过以上内容的审计，可以全面评估工程项目的财务状况和合规性，确保项目按照批准的设计和预算进行，并且资金使用的真实性和合法性得到保障。