可以进行工程审计的公司主要有以下几类：

会计师事务所

会计师事务所拥有专业的注册会计师和丰富的审计经验，能够对工程项目的财务收支、账务处理等进行全面审查，确保工程资金的合理使用和财务数据的真实性。例如，在对大型基础设施项目的审计中，会计师事务所可以通过审查项目的预算执行情况、资金流向等，发现潜在的财务风险和问题。

工程造价咨询公司

这类公司的专业人员主要是工程造价师，他们专注于工程建设项目的造价管理和审计工作，能够对工程项目的工程量计算、工程计价、费用核算等进行精确审核，为工程结算提供准确依据。比如在建筑工程的审计中，工程造价咨询公司可以详细审查工程图纸、施工变更等资料，核实工程量的准确性，避免施工单位虚报工程量。

工程咨询公司

工程咨询公司的业务范围较广，包括工程前期的可行性研究、项目评估，以及工程实施过程中的监理、审计等服务。其专业团队具备工程技术、经济管理等多方面的知识和经验，能够从工程建设的全过程角度进行审计，对工程的质量、进度、投资等方面进行综合评估，为项目的顺利实施和竣工验收提供保障。

其他专业机构

除了上述三类公司外，还有一些其他专业机构也可以提供工程审计服务，例如专业的造价师事务所、工程评估公司等。这些机构通常也具备相应的资质和资格，能够按照相关法律法规和行业标准进行工程审计。

建议

在选择工程审计公司时，建议考虑以下因素：

公司资质：确保选择的公司具有合法的审计资质和相关职业资格证书，以保证审计工作的专业性和可靠性。

经验与口碑：选择有丰富经验和良好口碑的公司，以确保审计质量和效率。

服务项目：明确审计服务的具体内容，选择能够提供全面、细致审计服务的公司。

费用：根据项目规模和预算，选择费用合理且透明的公司。

通过综合评估这些因素，可以选择到合适的工程审计公司，确保工程项目的顺利进行和合规性。