工程跨年度收入的确认方法主要依据完工进度（完工百分比）法。具体步骤如下：
提供劳务交易结果可靠估计
企业在各个纳税期末，如果提供劳务交易的结果能够可靠估计，应采用完工进度（完工百分比）法确认提供劳务收入。
跨年度工程预缴税款
对于跨年度工程，如果持续时间不超过12个月，企业可以按照完工进度进行预缴税款。待工程全部完成后，再进行税款的结清。
未完工工程收款处理
未完工工程收到工程款时，先记入“预收账款”科目。年底时，根据工程施工进度确认当年的营业收入及营业成本。
按完工比例确认收入
按照每年末或资产负债表日的完工进度来确认收入。例如，如果合同总收入为10000元，在08年末工程完工20%，则08年的收入为2000元。
权责发生制确认收入
收入确认应遵循权责发生制原则，即根据实际完成的工作量来确认收入，而不是根据每次开具的工程款。
跨年度工程成本结转
工程成本跨年结转时，本期发生的成本计入“主营业务成本”，根据工程进度和合同总收入确认“主营业务收入”，两者之间的差额进入“工程施工-合同毛利”。
建议
企业在处理跨年度工程收入时，应严格按照完工进度法进行确认，并在每个纳税期末进行预缴税款，以确保税务处理的准确性和合规性。
同时，企业应注重合同管理，明确工程进度和收入确认的具体时点，以便及时准确地反映财务状况和经营成果。
