制药工程环保论文可以从以下几个方面进行撰写：

研究背景

制药工业的重要性和对环境的潜在影响。

低碳经济和可持续发展的重要性。

制药废水的来源和特性

制药废水的分类（如化学合成废水、生物制药废水等）。

制药废水的特点（如高COD、难降解物质等）。

制药废水对环境的危害（如水体污染、生态破坏等）。

现有处理技术的分析和改进

常见的制药废水处理技术（如生化法、物理法、化学法等）。

现有技术的优缺点分析。

对现有技术的改进建议和新方法的研究。

案例分析

具体的制药企业废水处理案例。

处理技术的选择和实施过程。

处理效果和环境效益。

环保法规和政策

国内外制药工业环保法规和政策。

法规对制药企业环保行为的影响。

企业如何遵守相关法规和政策。

企业环保实践

制药企业的环保制度建设。

环保设施的投资和运行管理。

节能减排措施和清洁生产实践。

未来展望

制药工业环保技术的发展趋势。

绿色制药的理念和实践。

对未来制药工业环保工作的建议。

示例论文结构

引言

制药工业的重要性和环保的必要性。

研究目的和意义。

制药废水的来源和特性

制药废水的分类和特点。

制药废水的危害。

现有处理技术的分析和改进

生化法、物理法、化学法等技术分析。

现有技术的优缺点。

新方法的研究和实验设计。

案例分析

具体企业废水处理案例。

技术选择和实施过程。

处理效果和环境效益。

环保法规和政策

国内外环保法规和政策概述。

法规对企业环保行为的影响。

企业环保实践

环保制度建设和管理。

节能减排措施。

清洁生产实践。

未来展望

环保技术的发展趋势。

绿色制药的理念和实践。

建议和未来研究方向。

结论

通过以上结构和内容，可以系统地探讨制药工程中的环保问题，并提出相应的解决方案和建议，为制药行业的可持续发展提供理论支持和实践指导。