工程预缴2%的税金计算方法如下：
计算预收款：
建筑施工企业在与建设单位签订合同时，按照合同约定收取的预收款。
计算分包款：
建筑施工企业将部分工程分包给其他施工单位，支付的分包款。
计算应预缴增值税：
预收款减去分包款，得到应预缴增值税的金额。
计算预缴税金：
应预缴增值税乘以2%，即为需要预缴的税金总额。
具体的计算公式可以表示为：
[
text{预缴税金} = （text{预收款} - text{分包款}） times 2%
]
此外，如果涉及到跨县（市、区）提供建筑服务，还需要注意以下事项：
一般纳税人跨县（市、区）提供建筑服务，适用一般计税方法计税的，以取得的全部价款和价外费用扣除支付的分包款后的余额，按照2%的预征率计算应预缴税款。
一般纳税人跨县（市、区）提供建筑服务，选择适用简易计税方法计税的，以取得的全部价款和价外费用扣除支付的分包款后的余额，按照3%的征收率计算应预缴税款。
小规模纳税人跨县（市、区）提供建筑服务，以取得的全部价款和价外费用扣除支付的分包款后的余额，按照3%的征收率计算应预缴税款。
建议在实际操作中，根据具体的业务类型和税务规定，选择合适的计算方法和税率进行预缴税金的计算。
