工程部提成的计算方法主要有以下几种：

按工程项目的总利润进行分配

根据工程项目的总利润来确定工程部提成的比例。例如，若工程项目总利润为100万元，工程部提成比例为5%，则工程部可获得5万元的提成。

按工程人员的业绩进行分配

根据工程人员个人的业绩来确定其提成的比例。例如，若个人业绩为50万元，提成比例为10%，则个人将获得5万元的提成。

按项目利润比例分配

按照项目利润比例来分配提成。例如，若某项目的总利润为100万元，工程部为该项目贡献了30%的利润，则工程部可以获得30万元的提成奖励。

按员工完成工作量分配

按照员工完成工作量占比来分配提成。例如，若某项目的总工作量为100小时，工程部共有30名员工参与该项目，其中张三完成了10小时的工作量，李四完成了20小时的工作量，王五完成了30小时的工作量，其他员工平均完成了每人2小时的工作量，则张三可获得提成奖励10万元，李四可获得提成奖励20万元，王五可获得提成奖励30万元，其他员工每人可获得提成奖励1000元。

按合同完成工程施工任务

根据合同完成工程施工任务，工程质量合格，完成必须的签证签单，工程交付顺利，按以下比例提成：

总结算价在200万元以下（含），按0.7%计提；

总结算价在200-500万元（含），按0.6%计提；

总结算价在500万元 -1000万元的工程，按0.5%计提；

总结算价在1000万元（含）以上，按0.4%计提。

按单个拓展项目提成

工程按单个拓展项目提成，提成根据总工造价及最终利润综合评定分三级提成：

一级提成为总造价的4%；

二级提成为总造价的3%；

三级提成为总造价的2%。

按单个监管项目提成

工程按单个监管项目提成，提成根据单个工程的最终利润，工程项目负责人分三级提成：

一级提成为最终利润的10%；

二级提成为最终利润的8%；

三级提成为最终利润的5%。

在实际操作中，可以根据公司的具体情况选择适合的提成计算方法，并确定提成的比例和上下限，以确保提成的公平合理。同时，建议设立提成池，将工程项目的总利润的一定比例设为提成池，用于对工程人员进行提成，并根据工程人员的业绩进行分配。